Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nup188Q6ZQH8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nup188Q6ZQH8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nup188Q6ZQH8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms