Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Topbp1Q6ZQF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Topbp1Q6ZQF0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms