Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Chsy1Q6ZQ11 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Chsy1Q6ZQ11 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms