Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LcorQ6ZPI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LcorQ6ZPI3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms