Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

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Length 68 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pcp4l1Q6W8Q3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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