Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ift172Q6VH22 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ift172Q6VH22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ift172Q6VH22 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms