Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc88cQ6VGS5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms