Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc9c1Q6UJY2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc9c1Q6UJY2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.6 ms