Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GcsamQ6RFH4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
GcsamQ6RFH4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GcsamQ6RFH4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms