Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc57Q6PHN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc57Q6PHN1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms