Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtifQ6PEE2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtifQ6PEE2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtifQ6PEE2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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