Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Chd4Q6PDQ2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chd4Q6PDQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chd4Q6PDQ2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms