Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dtx4Q6PDK8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms