Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mfsd4aQ6PDC8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mfsd4aQ6PDC8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms