Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Bhlhb9Q6PB60 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Bhlhb9Q6PB60 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms