Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Gapvd1Q6PAR5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gapvd1Q6PAR5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gapvd1Q6PAR5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms