Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ1

Bcr, Breakpoint cluster region protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcrQ6PAJ1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BcrQ6PAJ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BcrQ6PAJ1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms