Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Slf2Q6P9P0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slf2Q6P9P0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms