Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak2Q6P9N8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak2Q6P9N8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak2Q6P9N8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trak2Q6P9N8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trak2Q6P9N8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Trak2Q6P9N8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms