Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc148Q6P5U8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccdc148Q6P5U8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc148Q6P5U8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms