Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp12Q6P5B0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rrp12Q6P5B0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms