Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Abcf1Q6P542 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcf1Q6P542 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Abcf1Q6P542 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcf1Q6P542 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
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