Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Podnl1Q6P3Y9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Podnl1Q6P3Y9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Podnl1Q6P3Y9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms