Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Slx4Q6P1D7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Slx4Q6P1D7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slx4Q6P1D7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms