Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rad17Q6NXW6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rad17Q6NXW6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rad17Q6NXW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms