Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CltbQ6IRU5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CltbQ6IRU5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms