Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Arhgap20Q6IFT4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Arhgap20Q6IFT4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Arhgap20Q6IFT4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 279.7 ms