Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KdsrQ6GV12 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KdsrQ6GV12 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms