Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nckap5lQ6GQX2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nckap5lQ6GQX2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nckap5lQ6GQX2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms