Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC6

Tro, Tro protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TroQ6DIC6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TroQ6DIC6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TroQ6DIC6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms