Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx11Q6AXC6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ddx11Q6AXC6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ddx11Q6AXC6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms