Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Rftn1Q6A0D4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rftn1Q6A0D4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms