Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ltn1Q6A009 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ltn1Q6A009 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ltn1Q6A009 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms