Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzrn3Q69ZS0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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