Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdk13Q69ZA1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk13Q69ZA1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdk13Q69ZA1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms