Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z37

Samd9l, Sterile alpha motif domain-containing protein 9-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd9lQ69Z37 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Samd9lQ69Z37 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Samd9lQ69Z37 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Samd9lQ69Z37 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Samd9lQ69Z37 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Samd9lQ69Z37 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Samd9lQ69Z37 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Samd9lQ69Z37 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms