Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spty2d1Q68FG3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spty2d1Q68FG3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms