Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CilpQ66K08 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CilpQ66K08 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms