Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna3Q65CL1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ctnna3Q65CL1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms