Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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Clcn1Q64347 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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Clcn1Q64347 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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Clcn1Q64347 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clcn1Q64347 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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Clcn1Q64347 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Clcn1Q64347 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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Clcn1Q64347 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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Clcn1Q64347 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clcn1Q64347 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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