Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Surf4Q64310 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Surf4Q64310 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms