Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa17Q64016 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa17Q64016 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Defa17Q64016 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms