Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col4a5Q63ZW6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col4a5Q63ZW6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms