Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift52Q62559 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift52Q62559 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms