Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Itga3Q62470 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Itga3Q62470 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Itga3Q62470 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms