Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vat1Q62465 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vat1Q62465 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms