Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sp4Q62445 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp4Q62445 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp4Q62445 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp4Q62445 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms