Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ndufa4Q62425 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ndufa4Q62425 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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