Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim28Q62318 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim28Q62318 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim28Q62318 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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