Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tspan7Q62283 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tspan7Q62283 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tspan7Q62283 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms